Le système digestif, appelé aussi appareil digestif, est l'ensemble des organes qui chez les animaux a pour rôle d'assurer l'ingestion et la digestion des aliments pour en extraire l'énergie et les nutriments nécessaires à la survie de l'organisme qui sont ensuite absorbés par l'organisme. Ce système est essentiel à la vie des animaux et se retrouve nécessairement pour toutes les espèces. Le rôle du ce système biologique est également d'assurer l'excrétion des matières alimentaires qui n'ont pu être absorbées par l'organisme.

Le système digestif varie de manière plus ou moins importante d'un animal à un autre. Ainsi il peut être très simple pour les organismes unicellulaires et les éponges où il n'y a pas de système digestif différenciés et où la digestion des aliments se fait au sein même de leurs cellules. Ou bien être différencié mais sans spécialisation comme chez les cnidaires et les vers plats où la digestion est assurées au sein de la cavité gastrovasculaire et où la bouche et l'anus sont indifférenciés. La spécialisation commence lorsque la bouche et l'anus sont différenciés et qu'ainsi les aliments passent successivement dans une série d'organes plus ou moins nombreux selon les espèces. Les nématodes sont un exemple de système digestif spécialisé très simple ne disposant que d'une bouche, d'un pharynx, d'un intestin et d'un anus. Mais le nombre d'organes et leur complexité peut augmenter selon le régime alimentaire qui nécessite plus où moins de traitement pour que la digestion soit assurée. C'est ainsi que les ruminants disposent de plusieurs organes supplémentaires et d'un estomac à plusieurs chambres.

L'étude du système digestif d'un animal permet de déterminer de nombreuses choses sur son régime et comportement alimentaire. C'est ainsi qu'avec les seules dents, les anthropologues sont capables de déterminer si un hominidé était en majorité herbivore ou omnivore.